蛋白按功能分，可分為以下幾種：
1.白細胞介素(Interleukin，IL)
由多種細胞產生并作用于多種細胞的一類細胞因子。由于最初是由白細胞產生且又在白細胞間發揮作用，所以得名，現仍沿用此名。
2.干擾素(interferon，IFN)
具有干擾病毒復制的能力，故得名。其具有十分廣泛的生物活性，在免疫應答和免疫調節中發揮重要作用，也是主要的促炎細胞因子之一。干擾素分為：I型(7種，如IFN-α和IFN-β)和II型(僅有IFN-Y)
3.腫瘤壞死因子(tumor necrosis factor,TNF)
由于在體內外均可直接殺傷腫瘤細胞而得名。其家族成員約有30個。
蛋白主要成員：
1) TNF-α，一種單核因子主要由單核細胞和巨噬細胞產生。
2) TNF-β，一種淋巴因子，主要由淋巴細胞、NK細胞等產生，其生物學活性與TNF-α相類似。
4.集落刺激因子(colony stimulating factor，CSF)
一組在體內外均可選擇性刺激造血祖細胞增殖、分化并形成某一譜系細胞集落的細胞因子，包括巨噬細胞CSF、粒細胞CSF、巨噬細胞/粒細胞CSF、干細胞因子等。
5.生長因子(growth factor，GF)
一類可介導不同類型細胞生長和分化的細胞因子，根據其功能和所作用細胞的不同，分別命名為轉化生長因子(TGF)、神經生長因子(NGF)、表皮生長因子(EGF)、血管內皮細胞生長因子(VEGF)、成纖維細胞生長因子(FGF)等。
6.趨化性細胞因子(chemokine)
一類對不同靶細胞具有趨化效應的細胞因子家族，可由白細胞和某些組織細胞分泌，是一個包括60多個成員的蛋白質家族。大部分成員含4個保守的半胱氨酸(cysteine，C)根據其N端半胱氨酸的排列方式，可分為CXC、CC、C、CX3C四個亞族。
